Ezután az AS Roma sportigazgatója lesz. Totti 1993-ban mutatkozott be a felnőtt csapatban, amellyel 2001-ben bajnokságot, 2007-ben és 2008-ban Olasz Kupát, 2001-ben és 2007-ben pedig Olasz Szuperkupát nyert.
Az AS Roma csapatkapitánya 25 év alatt 616-szor lépett pályára az olasz élvonalban, ezzel harmadik az örökrangsorban. A Serie A-ban 250 gólt szerzett és bekerült a 2000-es Európa-bajnokság és a 2006-os világbajnokság álomcsapatába. Előbbi tornán a döntő legjobbjának választották, annak ellenére, hogy az olaszok hosszabbításban 2-1-re kikaptak a franciáktól, utóbbi eseményen pedig a legtöbb gólpasszt adta. Olasz gólkirály volt 2007-ben, amellyel a legjobb európai góllövőnek járó Aranycipőt is kiérdemelte. Totti 2014-ben, 38 évesen és 59 naposan a legidősebb játékos lett, aki gólt szerzett a Bajnokok Ligája főtábláján.